Før det kan beregnes suppleringsskatt for den enkelte konsernenhet, skal det beregnes total suppleringsskatt for den enkelte jurisdiksjon. Suppleringsskatten for den enkelte jurisdiksjon utgjør suppleringsskattesatsen multiplisert med det overskytende skattegrunnlaget, tillagt ev. etterberegnet suppleringsskatt og fratrukket ev. kvalifisert nasjonal suppleringsskatt, jf. suppleringsskatteloven § 5‑1 annet ledd annet punktum. Om beregning av suppleringsskattesatsen, sepkt. 8.2. Om overskytende skattegrunnlag, sepkt. 8.4. Om nasjonal suppleringsskatt, sepkt. 9.2. Om etterberegnet suppleringsskatt, sepkt. 8.5.2.

Etterberegnet suppleringsskatt skal legges til ved beregningen av suppleringsskatten for den enkelte jurisdiksjon, jf. suppleringsskatteloven § 5‑1 annet ledd annet punktum. Etterberegnet suppleringsskatt er beløp beregnet etter suppleringsskatteloven § 4‑1 femte ledd og § 5‑4, jf. suppleringsskatteloven § 5‑1 annet ledd bokstav c.

Etterberegning av suppleringsskatt kan oppstå hvis den effektive skattesatsen for ett eller flere regnskapsår endres etter det som i modellreglene omtales som «ETR Adjustment Articles». Dette omfatter regler i suppleringsskatteloven som kan gi tilbakevirkende virkning basert på hendelser etter det aktuelle regnskapsåret:

• Skattlegging av samlet netto gevinst fra avhendelse av fast eiendom i jurisdiksjonen til tredjepart utenfor konsernet (suppleringsskatteloven § 3‑2 sjette ledd)
• Tilbakeføring av midlertidige forskjeller ved manglende betaling eller reversering av utsatt skatteforpliktelse (suppleringsskatteloven § 4‑2 syvende ledd)
• Manglende betaling av betalbar skatt innen 3 år, dersom den er over 1 million euro (forskrift til suppleringsskatteloven § 4‑1‑4 fjerde ledd)
• Tilbakeført skatt i jurisdiksjoner med regler om skatt ved utdeling (suppleringsskatteloven § 7‑3)

I tillegg omfatter den endringer i omfattede skatter i tidligere års regnskap, som medfører lavere omfattede skatter (som vanligvis vil resultere i økt suppleringsskatt), jf. forskrift til suppleringsskatteloven § 4‑1‑4 første ledd. 

Det skal da foretas en ny beregning av suppleringsskatten, jf. suppleringsskatteloven § 5‑4 jf. § 5‑1 til § 5‑3, for de aktuelle regnskapsårene. Ev. økt suppleringsskatt skal behandles som etterberegnet suppleringsskatt som skal fordeles på konsernenhetene i den aktuelle jurisdiksjonen i det regnskapsåret hvor etterberegningen gjennomføres, jf. suppleringsskatteloven § 5‑4 første ledd. Det skal ikke gjøres endringer i fastsettingen av suppleringsskatten for de tidligere årene eller leveres noen endret informasjonsmelding som følge av dette.

Hvis konsernenheten ikke har noe samlet overskudd i det aktuelle regnskapsår som etterberegningen gjelder, skal det gjøres en særlig justering i reglene for fordeling av skatteplikt etter suppleringsskatteloven § 2‑4 annet ledd, slik at skatteøkningen likevel kan føre til skatteplikt i morselskapsjurisdiksjoner som har innført skatteinkluderingsregelen. Justeringen innebærer at det justerte overskuddet til konsernenhetene i jurisdiksjonen oppjusteres etter suppleringsskatteloven § 2‑4 annet ledd, tilsvarende den etterberegnede suppleringsskatten delt på 15 prosent, jf. suppleringsskatteloven § 5‑4 annet ledd.

Etterberegnet suppleringsskatt kan oppstå på grunn av særregelen i suppleringsskatteloven § 4‑1 femte ledd, sepkt. 6.5. Etter suppleringsskatteloven § 5‑4 tredje ledd skal da hver konsernenhets justerte overskudd i jurisdiksjonen etter suppleringsskatteloven § 2‑4 andre ledd anses å tilsvare suppleringsskatten, fordelt til denne konsernenheten delt på en sats på 15 %. Den økte suppleringsskatten skal bare fordeles til konsernenheter med justerte skatter som er negative, og mindre enn konsernenhetens justerte resultat multiplisert med 15 %.

Konsernenheter som ilegges etterberegnet suppleringsskatt, skal anses som underbeskattet konsernenhet etter reglene i suppleringsskatteloven § 2‑1 til § 2‑5. Se suppleringsskatteloven § 5‑4 fjerde ledd.

Kvalifisert nasjonal suppleringsskatt skal trekkes fra ved beregningen av den ordinære suppleringsskatten for jurisdiksjonen, jf. suppleringsskatteloven § 5‑1 annet ledd. Om nasjonal suppleringsskatt, sepkt. 9.2. Det er det betalbare beløpet under en kvalifisert nasjonal suppleringsskatt som er påløpt for regnskapsåret som kan fradras, jf. suppleringsskatteforskriften § 5‑1‑1. En ilagt kvalifisert nasjonal suppleringsskatt kommer ikke til fradrag dersom konsernet, direkte eller indirekte, bestrider den nasjonale suppleringsskatten i en rettslig eller administrativ prosess. Det samme gjelder hvor skatteadministrasjonen i den ileggende jurisdiksjonen fastslår at skatten ikke kan fastsattes eller inndrives basert på konstitusjonelle skranker, annet lovverk med forrang, eller basert på avtale mellom myndighetene i jurisdiksjonen som begrenser konsernets skatteplikt. En ev. suppleringsskatt som ikke anses betalbar, skal medregnes og fradras i det regnskapsåret den knytter seg til, når kravet er betalt og den ikke lenger er omstridt.